Τα μυστικά του DNA Looping θα μπορούσαν να μας δώσουν το πάνω χέρι στον αγώνα κατά του καρκίνου

Πώς συσκευάζει ένα κύτταρο το συνονθύλευμα των γενετικών του δεδομένων σε καθαρά χρωμοσώματα για διαίρεση; Το DNA στα κύτταρά μας, τελικά, εκτείνεται σε περίπου δύο μέτρα σε μήκος και πρέπει να χωρέσει σε έναν πυρήνα περίπου στο 1/50 του μεγέθους ενός κόκκου αλατιού. Πώς στο καλό κανονίζει αυτό το κουβάρι πριν χωριστεί στα δύο;

Νέα έρευνα έχει ρίξει κυριολεκτικά φως στη διαδικασία, κινηματογραφώντας ένα σύμπλεγμα πρωτεΐνης που ονομάζεται condensin καθώς αντλεί βρόχους από το DNA.

Προηγούμενες μελέτες έχουν υποστηρίξει ότι η συμπύκνωση δρα σαν ένας μικροσκοπικός κινητήρας για να δημιουργήσει βρόχους στο DNA. Η ιδέα είναι ότι πολλές από αυτές τις πτυχές επιτρέπουν σε ένα κύτταρο να συμπιέζει το γονιδίωμά του για διανομή μεταξύ των θυγατρικών κυττάρων. Μέχρι στιγμής, όμως, αυτός ο ρόλος δεν έχει αποδειχθεί. Απομονώνοντας ένα μόριο DNA και προσανατολίζοντάς το προσεκτικά με ένα σύμπλεγμα συμπυκνίνης κάτω από ένα μικροσκόπιο, επιστήμονες από το Ινστιτούτο Kavli του Πανεπιστημίου Ντελφτ και το EMBL Heidelber έχουν κινηματογραφήσει την πρωτεΐνη σε δράση.

«Η τεχνική μπορεί να φαίνεται πολύ απλή («Απλώς απεικονίστε το DNA και τη συμπύκνωση») αλλά δεν είναι καθόλου ασήμαντη», λέει στον Alphr ο καθηγητής Cees Dekker, επικεφαλής της ερευνητικής ομάδας στο τμήμα βιονανοεπιστήμης στο Ντελφτ . «Κάποιος πρέπει να απεικονίσει το DNA χωρίς υπερβολική ζημιά στη φωτογραφία.

«Όταν ρίχνεις φως στο DNA για να γίνει ορατό, αυτό το φως μπορεί επίσης να δημιουργήσει ζημιά (που ονομάζεται φωτοφθορές) και επομένως να σπάσει το DNA. Αυτό συνέβη, για παράδειγμα, όταν ξεκινήσαμε αυτήν την έρευνα πριν από οκτώ χρόνια με πιο τυπική βαφή χρώματος που θα έσπασε και θα έσπασε το DNA μέσα σε λίγα δευτερόλεπτα».

Ο Mahipal Ganji, μεταδιδάκτορας στην ομάδα Cees Dekker του Ντελφτ, εξηγεί ότι το πρώτο βήμα στη νέα διαδικασία απεικόνισης ήταν να στερεωθούν τα δύο άκρα ενός μορίου DNA σε μια επιφάνεια και να εφαρμοστεί προσεκτικά η βαφή: «Μέχρι τότε εφαρμόζοντας μια ροή στο υγρό κάθετα στο μόριο, προσανατολίσαμε το DNA σε σχήμα U και το φέραμε στο εστιακό επίπεδο του μικροσκοπίου μας. Παραδόξως, μπορούσαμε στη συνέχεια να δούμε μια ενιαία συμπύκνωση να δεσμεύεται και να αρχίσουμε να εξωθούμε έναν βρόχο».

Δείτε σχετικά 

Οι επιστήμονες χρησιμοποίησαν το CRISPR για να αποθηκεύσουν ένα GIF μέσα στο DNA ενός ζωντανού κυττάρου

Σύμφωνα με τον Dekker, το βίντεο «καθορίζει τη συζήτηση» σχετικά με την ικανότητα του condensin να σχηματίζει βρόχους στο DNA. Η ομάδα παρατήρησε επίσης ότι το τύλιγμα είναι ασύμμετρο, με τη συμπύκνωση να τραβά μόνο το DNA από τη μία πλευρά του αγκυρωμένου σημείου της. Η διαδικασία του βρόχου απαιτεί μόνο μια μέτρια ποσότητα ATP για να τροφοδοτήσει τη συμπυκνίνη, υποδηλώνοντας ότι το πρωτεϊνικό σύμπλεγμα δεν τραβά τη βάση του DNA με βάση, αλλά σε μεγάλα κομμάτια. Ο μικροσκοπικός κινητήρας το κάνει αυτό εξαιρετικά γρήγορα, τυλίγοντας έως και 1.500 ζεύγη βάσεων ανά δευτερόλεπτο.

Τα ευρήματα έχουν σκοπό όχι μόνο να διασαφηνίσουν έναν θεμελιώδη μηχανισμό μίτωσης και μείωσης, αλλά μπορούν να χρησιμοποιηθούν για να βοηθήσουν στη θεραπεία ιατρικών προβλημάτων που σχετίζονται με την οικογένεια πρωτεϊνών που αποτελεί μέρος της συμπύκνωσης, γνωστές ως πρωτεΐνες SMC. Όπως εξηγεί ο Dekker, αυτό θα μπορούσε να μας βοηθήσει να κατανοήσουμε καλύτερα πώς να καταπολεμήσουμε τον καρκίνο:

«Οι πρωτεΐνες SMC είναι ζωτικής σημασίας για την οργάνωση των χρωμοσωμάτων. Η διαταραχή της σωστής κατανομής του χρωμοσωμικού υλικού στα θυγατρικά κύτταρα σχετίζεται με καρκίνο. Επομένως, η βασική κατανόηση των πρωτεϊνών SMC βρίσκεται στο επίκεντρο της κατανόησης των διασπαστικών διαδικασιών που οδηγούν στον καρκίνο. Πιο συγκεκριμένα, οι μεταλλάξεις στις πρωτεΐνες SMC σχετίζονται με κληρονομικές παθήσεις όπως το σύνδρομο Cornelia de Lange».

Τα ευρήματα από το Ινστιτούτο Kavli του Πανεπιστημίου Ντελφτ και το EMBL Heidelber δημοσιεύονται σήμερα στο περιοδικό Science .

Πίστωση εικόνας: Cees Dekker Lab TU Delft/Scixel


Leave a Comment

Πώς να βρείτε και να διαγράψετε αποθηκευμένους κωδικούς πρόσβασης στο Microsoft Edge

Πώς να βρείτε και να διαγράψετε αποθηκευμένους κωδικούς πρόσβασης στο Microsoft Edge

Δείτε πώς μπορείτε να διατηρείτε τους κωδικούς πρόσβασής σας στον Microsoft Edge υπό έλεγχο και να αποτρέψετε το πρόγραμμα περιήγησης από το να αποθηκεύει τυχόν μελλοντικούς κωδικούς πρόσβασης.

Πώς να αλλάξετε το φόντο σας και να κάνετε την επιφάνεια εργασίας σας να φαίνεται θετικά μοναδική στα Windows 11

Πώς να αλλάξετε το φόντο σας και να κάνετε την επιφάνεια εργασίας σας να φαίνεται θετικά μοναδική στα Windows 11

Ακολουθήστε αυτόν τον οδηγό για το πώς να αλλάξετε το φόντο σας και να κάνετε την επιφάνεια εργασίας σας να φαίνεται θετικά μοναδική στα Windows 11.

Πώς να ενεργοποιήσετε τις συνδέσεις απομακρυσμένης επιφάνειας εργασίας στον υπολογιστή σας Windows 10

Πώς να ενεργοποιήσετε τις συνδέσεις απομακρυσμένης επιφάνειας εργασίας στον υπολογιστή σας Windows 10

Ανακαλύψτε πώς να ενεργοποιήσετε τις εισερχόμενες συνδέσεις απομακρυσμένης επιφάνειας εργασίας στα Windows 10 και να αποκτήσετε πρόσβαση στον υπολογιστή σας απομακρυσμένα.

Πώς να αυξήσετε τη φωτεινότητα της οθόνης στα Windows 10

Πώς να αυξήσετε τη φωτεινότητα της οθόνης στα Windows 10

Ανακαλύψτε πώς να ρυθμίσετε τη φωτεινότητα της οθόνης στα Windows 10 για καλύτερη οπτική εμπειρία και διάρκεια ζωής μπαταρίας.

Πώς να αλλάξετε το θέμα, τα χρώματα και πολλά άλλα για να δημιουργήσετε μια εκπληκτική εμπειρία επιφάνειας εργασίας στα Windows 11

Πώς να αλλάξετε το θέμα, τα χρώματα και πολλά άλλα για να δημιουργήσετε μια εκπληκτική εμπειρία επιφάνειας εργασίας στα Windows 11

Ακολουθεί ένας οδηγός για το πώς να αλλάξετε το θέμα, το χρώμα και πολλά άλλα στα Windows 11 για να δημιουργήσετε μια εκπληκτική εμπειρία επιφάνειας εργασίας.

Πώς να επαναφέρετε τον ήχο στον υπολογιστή μου

Πώς να επαναφέρετε τον ήχο στον υπολογιστή μου

Αν έχετε πρόβλημα με τον ήχο στον υπολογιστή σας με Windows 10, ακολουθήστε αυτά τα βήματα για να επαναφέρετε τον ήχο άμεσα.

Windows 10 How-to: Συγχρονισμός ρυθμίσεων υπολογιστή σε όλες τις συσκευές Windows 10

Windows 10 How-to: Συγχρονισμός ρυθμίσεων υπολογιστή σε όλες τις συσκευές Windows 10

Ανακαλύψτε πώς να συγχρονίσετε τις ρυθμίσεις σας στα Windows 10 με απόλυτη ευκολία. Αυτή η οδηγία θα σας καθοδηγήσει στη διαδικασία συγχρονισμού.

Πώς να δείτε λεπτομερείς πληροφορίες συστήματος στα Windows 10

Πώς να δείτε λεπτομερείς πληροφορίες συστήματος στα Windows 10

Ανακαλύψτε πώς να δείτε λεπτομερείς πληροφορίες για το υλικό και το λογισμικό του υπολογιστή σας στα Windows 10 με τον οδηγό μας.

Πώς να διατηρήσετε την κατάσταση των ομάδων ενεργή / πράσινη / online / διαθέσιμη;

Πώς να διατηρήσετε την κατάσταση των ομάδων ενεργή / πράσινη / online / διαθέσιμη;

Μάθετε πώς να διατηρείτε την κατάσταση σας διαθέσιμη στο Microsoft Teams για καλύτερη επικοινωνία χρησιμοποιώντας απλές ρυθμίσεις.

Πώς να δείτε τους αποθηκευμένους κωδικούς πρόσβασης στο Chrome

Πώς να δείτε τους αποθηκευμένους κωδικούς πρόσβασης στο Chrome

Ανακαλύψτε πώς να προβάλλετε τους αποθηκευμένους κωδικούς πρόσβασης στο Google Chrome με απλές και ασφαλείς μεθόδους.